動物:貝類物種後設資料需求規格書(原 6-1-57 )

出自 TELDAP
前往: 導覽搜尋

計畫簡介與說明

臺灣位處於世界貝類分布數量最多的印度-太平洋海區內,因此臺灣貝類相是相當豐富的。其中應有超過50~60%為本土性的特有種。但是隨著人口壓力的增加、工業的長足發達、污染持續的擴大、再加上地震等天災所造成棲地的破壞等因素,已使得許多貝類物種數量遽減。因此有需要加速建立臺灣貝類典藏的數位化資料。

本計畫即擬利用申請人在中央研究院網路所建立的「臺灣貝類資料庫」為基礎架構,再加上近20 年來的採集記錄、資料文獻整理及標本典藏的成果,將臺灣貝類中較完整的1000~1250 種多項紀錄予以數位化典藏處理。相信此一數位化典藏系統,將有助於臺灣本土性自然生物教學、研究、管理等,甚至做為未來的國土利用與規劃,資源管理及本土自然教育推廣的基本素材。


計畫預期目標

  1. 以臺灣貝類資料庫為基礎,繼續充實更新各項內容,使其更加完整。
  2. 將所內極為珍貴的標本予以數位化典藏之外,並將標本的圖像拍照、建檔。
  3. 依據「拉漢/漢拉世界海貝名典」及「貝類決定版名典」中,世界較常見的貝類約6000 種,建置世界貝種中英學名查詢系統,供大眾查詢。
  4. 能與GIS 整合:制訂metadata,有關貝種臺灣分布資料能建立GIS 系統。

需求規格書範圍與進度限制

本份「臺灣動物相典藏之研究-貝類計畫後設資料需求規格書version 1.1」主要是依據90年度11月21日發佈的「臺灣動物相典藏之研究-貝類計畫後設資料需求規格書version 1.0」進行「物種名錄」部份需求的修正與調整,並加入「物種生物資訊」、「標本資料」、「文獻資料」、「媒體資料」與「系統帳號管理」部份的需求撰寫完成的。


計畫參與人員

v 中央研究院生物多樣性研究中心(動物相典藏計畫):巫文隆、林恆瑋、李彥錚

v 數位典藏國家型科技計畫後設資料工作組:陳亞寧、陳淑君、沈漢聰、莊順淑、鍾豐謙(規格書搷撰寫者)

著錄架構

著錄架構之主要目的在於讓主題計畫參與同仁確認建檔時所需著錄之後設資料欄位(因此一些由系統自動產生欄位值或設定固定值的欄位,因為不需由著錄人員著錄,故不列在著錄架構之內。)與欄位的先後排序,並供日後系統設計人員參考之用。貝類後設資料需求欄位依其內容描述性質分為六大類,分別為:物種名錄、物種生物資訊、標本資料、文獻資料合媒體資料與系統帳號管理,茲分述如下:

1. 物種名錄:

6160.5. 著錄架構.jpg

2. 物種生物資訊:

6160.5. 著錄架構2.jpg

3. 標本資料:

6160.5. 著錄架構3.jpg
6160.5. 著錄架構4.jpg

標本資料類的後設資料需求欄位又可分成五大區段,分別為:標本採集地點資訊、標本採集資訊、標本特徵資訊、標本紀錄與標本鑑定。

4. 文獻資料:

6160.5. 著錄架構5.jpg

5. 媒體資料:

6160.5. 著錄架構6.jpg

6. 系統帳號管理:

6160.5. 著錄架構7.jpg

需求欄位建置表

本需求欄位建置表主要把主題計畫所提出的需求欄位經系統化、架構化與後設資料標準化之後,並列成單表供系統開發人員建置資料庫時設定欄位所用,同時也供程式設計人員在撰寫程式時參考使用。需求欄位建置表之各項說明如下:

v 項目名稱:主題計畫所需著錄項目之中文名稱。

v 英文名稱:項目名稱對應之英文名稱。

v 資料型態:著錄資料之資料型態。包括:

n int 存放純數字的資料型態。

n Varchar、Text 存放純文字型態的資料。

v 大小:欄位所需之空間,以byte 為單位。一個英文字元或一個阿拉伯數字需用一個byte 表示,而一個中文字原則須兩個byte 表示。

1. 物種名錄:

6160.6. 需求欄位建置表.jpg
6160.6. 需求欄位建置表2.jpg

2. 物種生物資訊:

6160.6. 需求欄位建置表3.jpg

3. 標本資料:

6160.6. 需求欄位建置表4.gif
6160.6. 需求欄位建置表5.jpg

4. 文獻資料:

6160.6. 需求欄位建置表6.jpg

5. 媒體資料:

6160.6. 需求欄位建置表7.jpg

6. 系統帳號管理:

6160.6. 需求欄位建置表8.jpg

需求欄位屬性表

7. 需求欄位屬性表

需求欄位屬性表主要是把主題計畫之需求欄位的屬性匯集整理,並列成表單供系統建置人員參慷使用,需求欄位屬性表的各項說明如下:

v 項目名稱:主題計畫所需著錄之中文名稱。

v 必填:標示「*」者表示必填欄位,建檔時須填寫該欄位的值,不能空白。

v 多值:標示「◎」者表示為多值欄位,該組欄位資料可重複著錄。

v 屬性:標示該欄位的屬性,包括:

n 「唯一」表示欄位的值在資料庫中是唯一存在的。

n 「不開放」表示該欄位只供管理者使用,不對外開放。

n 「下拉式選單」表示著錄方式為下拉式的選單。

n 「預設值」表示由系統先預設一個值,著錄人員在著錄時可變更之。

n 「固定值」表示由系統產生一個固定值,著錄人員無法變更之。

n 「系統自動產生」表示該欄位的值是由系統自動產生,非由著錄人員著錄。

n 「link」表示該欄位須連結外部資料庫。

v 提供者: 記錄這筆資料是由系統自動產生或由填表人所填入。

1. 物種名錄:

6160.7. 需求欄位屬性表.jpg
6160.7. 需求欄位屬性表2.jpg

2. 物種生物資訊

6160.7. 需求欄位屬性表3.jpg

3. 標本資料:

6160.7. 需求欄位屬性表4.jpg
6160.7. 需求欄位屬性表5.jpg

4. 文獻資料:

6160.7. 需求欄位屬性表6.jpg

5. 媒體資料:

6160.7. 需求欄位屬性表7.jpg

6. 系統帳號管理:

6160.7. 需求欄位屬性表8.jpg

代碼表

在需求欄位屬性表之屬性欄位有標示「下拉式選單」者,其對應之下拉選單內容如下:

6160.8. 代碼表.jpg

後設資料標準比對表

設資料標準的對照是作為後設資料欄國際標準的接軌,以及與國際間其他主題計畫的XML 資料交換的關鍵機制。以下是貝類資料庫後設資料欄位與Species 2000 及NBN(National Biological Network)後設資料標準的對照表。

貝類數位典藏計畫的物種名錄部份,採用Species 2000 這套後設資料標準,其比對結果如下所示:

1. 物種名錄:

6160.9. 後設資料標準比對表.jpg
6160.9. 後設資料標準比對表2.jpg

貝類數位典藏計畫的物種生物資訊、標本資料、文獻資料與媒體資料部份,皆採用NBN(National Biological Network)這套後設資料標準,其比對結果如下所示:

2. 物種生物資訊:

6160.9. 後設資料標準比對表3.jpg

3. 標本資料:

6160.9. 後設資料標準比對表4.gif
6160.9. 後設資料標準比對表5.jpg

4. 文獻資料:

6160.9. 後設資料標準比對表6.jpg

5. 媒體資料:

6160.9. 後設資料標準比對表7.jpg

6. 系統帳號管理:

貝類數位典藏計畫的系統帳號管理欄位部份,係因應主題計畫之權限管控功能而設置的,故並不對照到任何後設資料標準。

查詢功能需求

v 簡要查詢:系統會對表單中簡要查詢欄位有標示△者作查詢,檢索所有欄位資料是否符合使用者提出的關鍵字。

v 進階查詢:對表單中進階查詢欄位有標示▲者的各別欄位作獨立查詢。

v 簡要顯示款目:對於表單中簡要查詢欄位作簡要查詢,若有符合的結果,則依照簡要顯示款目欄位中有標示△者回應給使用者。

v 詳細顯示款目:對表單中進階查詢欄位作進階查詢,有符合之結果依照詳細顯示款目欄位中有標示▲者回應給使用者。

1. 物種名錄:

6160.10. 查詢功能需求.jpg
6160.10. 查詢功能需求2.jpg

2. 物種生物資訊:

6160.10. 查詢功能需求3.jpg

3. 標本資料:

6160.10. 查詢功能需求4.jpg
6160.10. 查詢功能需求5.jpg

4. 文獻資料:

6160.10. 查詢功能需求6.jpg

5. 媒體資料:

6160.10. 查詢功能需求7.jpg

6. 系統帳號管理:

6160.10. 查詢功能需求8.jpg

系統功能需求說明

1. 避免重複著錄:

以各大類欄位主鍵作為簡持紀錄是否重複建檔。各大類欄位主鍵如下,而各大類以「拉丁動物學名」連結:

物種名錄:拉丁動物學名

物種生物資訊:拉丁動物學名

標本資料:標本編號

文獻資料:文獻紀錄編號

媒體資料:媒體編號

2. 主鍵欄位驗證

著錄各大欄位主鍵時,系統能有驗證及控制的機制。以下是各主鍵的格式。

6160.11. 系統功能需求說明.jpg

3. 著錄建檔的紀錄

著錄人員要進行紀錄建檔時,進入著錄介面之前需經過身份的確認,著錄人員必須輸入自己的姓名與密碼,方可登入Metadata 系統進行建檔,系統需記錄建檔人姓名與建檔時間。同樣的,當著錄人員需修改紀錄內容時,也需經過身份的確認,藉由確認的動作可知該筆記錄是經由誰人所修改,系統亦需記錄修改人姓名與修改時間。系統不需記錄每次的修改資訊,只需記錄最近一次的修改資訊即可。紀錄建檔後,不需要另一核對人進行資料的核對。

規格書確認表單

6160.12. 規格書確認表單.jpg

參考資料

參與研發單位:中央研究院-計算中心-後設資料工作組、中央研究院-生物多樣性研究中心(動物)

提供單位:中央研究院-計算中心-後設資料工作組

使用單位:中央研究院-生物多樣性研究中心(動物)